以前穆陵軍的主力兵力共分為六個步兵隊，一個弓箭手隊，一個騎兵隊和一個偵察隊，兵力總計為一千六百九十六人.
    現(xiàn)在六個步兵隊，每隊二百人的編制依然都保留。而弓箭手隊擴(kuò)大為兩個隊，毎隊一百八十人，均為一百二十名長弓手和六十名短弓手。騎兵隊為擴(kuò)大到一百八十人。偵察隊擴(kuò)大到一百二十人。各隊的隊長依然由原來的把總擔(dān)任。只是騎兵隊的隊長不在由唐鎮(zhèn)兼任，由楊武丞擔(dān)任，同時他還兼任士兵的槍術(shù)教師。另外增設(shè)的火槍隊一共為四百五十人，其中包括五十名炮手。由羅遠(yuǎn)斌擔(dān)任隊長和教官。
    這樣整編之后，穆陵軍的主力兵力共計是二千三百一十人，基本都是十八至三十五歲的靑年男子。而十四至十八歲的少年有二百八十七人，編為三個小隊。
    從箕厔村遷移到穆陵關(guān)的居民一共有三百二十七戶，共計一千0八十七口人，男子六百二十三口，女子四百六十四口。成年男子四百三十八人，其中十八至三十五歲的靑年男子為二百四十一人，三十五至四十五歲的壯年男子為二百0七人。十四至十八歲的少年有九十五人。
    因為箕屋村的團(tuán)兵經(jīng)過楊武丞的訓(xùn)練，基礎(chǔ)還比較好，因此有一倍份成年男子被抽調(diào)到騎兵隊里，商毅將剩下的成年男子編成兩個隊，少年編成一個少年隊。
    這樣一來，穆陵關(guān)的總兵力達(dá)到了三千多人，實力以經(jīng)非?？捎^了。
    隊伍整編完畢之后，商毅立刻下令，全軍開始進(jìn)行訓(xùn)練。
    其實從原來組建民團(tuán)時開始，到升格成為穆陵軍，士兵們一直都在按照商毅的要求，進(jìn)行著嚴(yán)格的訓(xùn)練。而這一次訓(xùn)練的重點，是剛剛加入穆陵軍箕屋村的士兵。首先當(dāng)然還是從隊列訓(xùn)練開始。
    和這個時代的大多數(shù)武將不同，商毅建軍的第一指導(dǎo)思想是士兵尊守紀(jì)律，服從命令的關(guān)念習(xí)慣，而不是士兵的個人戰(zhàn)斗能力。在這樣指導(dǎo)思想下，穆陵軍的士兵個人的戰(zhàn)斗力或許不算強(qiáng)，但作為一個團(tuán)隊，整體的作戰(zhàn)能力卻不容小視。隊列訓(xùn)練就是加強(qiáng)士兵尊紀(jì)服從觀練的最好方法。
    不過來自箕屋村的新兵顯然對這種枯燥乏味，又極為勞神費力的訓(xùn)練非常不適應(yīng)，加上大多數(shù)人都是農(nóng)民出身，在一開始的時候，和當(dāng)初的士兵一樣，跟本就分不淸左右。
    現(xiàn)在訓(xùn)練隊例這樣的事情也不用商毅再親力親為，都由穆陵軍過去的老兵付責(zé)，這些老兵自然也秉承了商毅的打罵訓(xùn)練法，一但新兵做錯了動作，就會立刻被老兵們罵了個狗血淋頭，“這么簡單的事情也不會，都是干什么吃的，”“練了幾天也記不住，就是這個樣子，上了戰(zhàn)場也是送死的貨”一邊罵著，還一邊舉著棍子，打了過來。
    結(jié)果幾天下來之后，新兵們幾乎每個人身上都掛上了幾條血印，不過商毅雖然不禁止他們責(zé)打士兵，但也不許訓(xùn)練他們的老兵下重手，更不許打要害部位，基本都是朝肉厚的地方下棍子，因此挨打的新兵雖多，但都沒有傷筋動骨。
    但盡管如此，因為新兵們大多都是剛從農(nóng)民轉(zhuǎn)化，以前那里受過這種折磨，也弄得叫苦不迭。有不少人都大覺吃不消，于是也有人開始耍小聰明，打歪點子，想法偷懶、磨蹭時間等等。
    但商毅對訓(xùn)練的監(jiān)督十分嚴(yán)格，一但發(fā)現(xiàn)有人偷懶、磨蹭，完不成訓(xùn)練量，也毫不客氣，立刻就拖出去打軍棍。在最初的一段時間，幾乎毎天都有新兵被拖出去挨打。
    不過商毅也知道剛?cè)嵯鏉?jì)的道理，正所謂是打一巴掌之后，還要給個甜栆吃。大棍也需要胡蘿卜來配合。因此在責(zé)打完士兵之后，就會立刻讓軍醫(yī)來給他們上藥，化於消腫，每天還親自看望士兵，弄得城里的郎中也納悶，要是千總大人真的心疼這些士兵，為啥又要打他們呢？
    而且訓(xùn)練雖然是苦了一點，但士兵的飯食卻一點也不含糊，老兵就不用說了，既使是新兵，每餐也是一大碗白米飯，外加兩個黑面野菜餅子，隔一天還可以吃到二兩肉，不時還會饹個白面大餅什么的，給調(diào)劑一下。許多新兵就是過去在家里，也吃不到這樣的飯萊。
    同時商毅也知道，對士兵的思想教育也絕對不能放松，因此也安排了一些年紀(jì)稍長的老兵，在休息的時候去和新兵談天，做他們的思想工作。
    新兵們覺得訓(xùn)練累，訓(xùn)練苦時，老兵就會告訴他們：“這也叫累、也叫苦嗎？當(dāng)初咱們跟著商大人組建民團(tuán)的時候，那才叫累才叫苦呢？在大太陽底下一站就是一個時辰，一動都不能動，就連要拉屎撒屎都憋著，毎天排著隊伍要走十幾里路，一步都不許錯，訓(xùn)練完了以后，人就在地上一躺，動都不想動了，幾天下來，整個人都要被扒了一層皮。你們現(xiàn)在這個樣子，以經(jīng)算是享福了。”
    “再都說了，嚴(yán)格督促你們訓(xùn)練也是為了你們好??！現(xiàn)在雖然是苦了一點，但練好了本事，等上了戰(zhàn)場以后，就會明白訓(xùn)練的好處了。想在戰(zhàn)場上活下來，就得靠平時苦練，到了那個時候，說不定你們還會怪教官們平時對你們管得還不夠嚴(yán)呢？”
    “啥？練走路沒啥用？要練就練長槍大刀？呵呵呵！小伙子??！這你可就不懂了，這個不叫走路，叫那個啥？哦！這叫隊列訓(xùn)練，可是重要著的呢？當(dāng)初商大人就是這么訓(xùn)練的我們，結(jié)果怎么樣呢？你們好好想想，自從咱們商大人從創(chuàng)辦民團(tuán)的長槍大刀時候開始，那可真就叫戰(zhàn)無不勝，什么青狼峰??！殺虎溝??！還有什么改世王、興世王啊這些個亂七八糟的流寇，那個不是在咱們穆陵軍手底下吃了大虧的。”
    “你沒看見嗎？就是咱們這些老兵，到了現(xiàn)在每天也還要練一練隊列呢？所以說你們別以為這個隊列訓(xùn)練沒用，練好了作用可大了呢？”
    “長槍大刀當(dāng)然也是要練，但凡事總有個先后吧，先把隊列練好，到時候大人自然會教你們練長槍大刀的，那句怎么說來著，走都還沒學(xué)會，就想著要跑，那怎么行呢？”
    “要說現(xiàn)在你們的日子真算不錯了，雖然訓(xùn)練累了點，苦了點，但不愁吃喝啊！頓頓都能吃飽不說，隔一天還有肉吃，就連你們的家人也能吃上飽飯吧？就是在家里也沒有這么好的日子吧！更別說還要時時擔(dān)心賊兵啥時會打來，天天提心吊膽的！”
    “什么？離開穆陵關(guān)？哼！年輕人，話是容易說，要是離開了穆陵關(guān)，上那兒去找咱們商大人這么好的人了！再說現(xiàn)在韃子都以經(jīng)打到山東來了，一出關(guān)準(zhǔn)保馬上沒命。而且就是出了穆陵關(guān)，你又能那兒去？除了咱們商大人，誰還會對你們這么好？你們要是還不好好訓(xùn)練，對得起商大人嗎？對得你們每天吃的這些飯嗎？”
    經(jīng)過了老兵們的思想工作之后,新兵們的情緒也漸漸穩(wěn)定了下來，訓(xùn)練的主動性也大大增加，也更認(rèn)真該苦了。
    而除了訓(xùn)練新兵之外，商毅對老兵同樣也沒有一點放松。當(dāng)然現(xiàn)在的老兵訓(xùn)練的重點以經(jīng)不再是隊列了，而是實戰(zhàn)能力。毎天商毅都會帶著老兵，出關(guān)去拉練，進(jìn)行埋伏，沖鋒、布陣、拒馬、撤退、箭陣、遭遇、渡河、搜索、扎營、夜戰(zhàn)等等實戰(zhàn)的演練。由其是專門訓(xùn)練山地叢林的作戰(zhàn)技術(shù)和演練。
    因為穆陵關(guān)位于沂山、峿山、箕屋山等數(shù)座大山的包圍內(nèi)，叢林茂密，山路復(fù)雜，都是不利于清軍的騎兵，重甲步兵作戰(zhàn)的地形，卻正是用兵埋伏的大好地區(qū)。
    商毅是特種兵出身，本身就是山地叢林戰(zhàn)的好手，甚至可以說在這個時代，論山地叢林戰(zhàn)術(shù)，無出其右者。而且他又是接受辻現(xiàn)代軍事理論教肯，同時也對共和國當(dāng)年的游擊戰(zhàn)術(shù)、運動戰(zhàn)術(shù)十分推崇。深知以我為主，牢牢把戰(zhàn)場主動權(quán)的道理。因此雖然是有關(guān)城可守，也絕不能一味的消極閉關(guān)死守，而是堅持將陣地戰(zhàn)和運動戰(zhàn)相結(jié)合，守中帶攻，攻守兼?zhèn)洹?br/>     正是在這種指導(dǎo)思想下，那么穆陵關(guān)周邊的地區(qū)如果能移加以有效的利用，不僅會對淸軍造成極大的麻煩，說不定還會起到出奇制勝的效果。因此商毅在訓(xùn)練士兵們山地叢林戰(zhàn)術(shù)的同時，一面也派人去勘測山路，繪制詳細(xì)的山地地圖，了解那里能藏身，那里能儲備，那里能用兵，那里能埋伏，那里是死路，那里能死里救活等等，做到心里有數(shù)。
    而在這個時候，傳教士阿科尼亞發(fā)揮了極大的作用。自從跟商毅一起到了穆陵關(guān)之后，由于現(xiàn)在世局不太平，因此洋和尚暫時放棄了北上進(jìn)京的想法，留在穆陵關(guān)里。同時也利用自己擅長的醫(yī)術(shù)，在穆陵關(guān)里充當(dāng)一名醫(yī)生，這一段時間里，也給不少人治過病，而中國農(nóng)民對出家人都帶有幾敬意，而會醫(yī)術(shù)的出家人，更是受人尊重。加上阿科尼亞為人和藹，又不呆板，雖然是個洋和尚，也很快和居民們熟悉起來。
    而阿科尼亞也趁機(jī)在居民中間傳教，商毅雖然打算限制阿科尼亞的行為，但在這種非常時刻，有一個宗教人士的幫助，也有利于穩(wěn)定居民的情緒。而且歷史也證明，中國農(nóng)民不會那么輕易就被上帝忽悠，因此也沒有對阿科尼亞加以阻攔。
    同時阿科尼亞不禁精通西式繪畫技術(shù)，而且也懂地圖繪制，因此也幫著商毅，勘測地形，丈量尺寸，繪制了一份穆陵關(guān)一帶方圓數(shù)十里的詳細(xì)地圖。
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